三年前的那场事故使得凉宫遥以及鸣海孝之的人生发生了巨大的变化。遥昏睡了整整三年即便是苏醒后的短时间内记忆也一直是处在混乱状态。孝之因为遥的事故而深受打击过着茫然自失的生活。但是全靠了速濑水月献身性的努力虽然几经周折但还是振作了起来现在在Family‐restaurant——Skytemple打工中。遥也找回了记忆病情也康复了马上就能够出院了。随后在遥出院的当天孝之以及好朋友平慎二遥的父亲宗一郎以及遥的妹妹茜一起前往医院迎接出院了的遥。但是在那里并没有出现一直支撑着孝之甚至想到过了结婚的水月的身影……